Arkeoloji Bölümü, Akdeniz bölgesinin doğu kesimlerinin arkeolojik önemi göz önünde bulundurularak 1992 yılında kurulmuştur. Akademik ve teknik altyapısını sağladıktan sonra 1998 yılında öğrenci almaya başlayan Arkeoloji Bölümü, 2002 yılından bu yana Yüksek Lisans, 2006 yılından bu yana da Doktora eğitimi vermektedir.